La structure de CANTAM est constituée d'unités essentielles de mise en œuvre appelées Work Packages. Actuellement, il y a 6 work packages coordonnés par leurs PIs ou institutions.

WP 1 

Études épidémiologiques et de surveillance sur le paludisme, la tuberculose, le VIH/SIDA, les MTN et le COVID-19

Dirigé par le Centre de Recherches Médicales de Lambaréné

WP 2

Renforcement de l'investigation clinique des médicaments traditionnels pour les infections parasitaires et virales

Dirigé par l'University of Yaoundé I

WP 3 

Pharmacovigilance, autorités réglementaires et comités d'éthique

Dirigé par l'University of Kinshasa

WP 4

Renforcement des capacités, développement de carrière et mentorat

Dirigé par le Centre International de Recherches Médicales de Franceville

WP 5

Mise en réseau, communication, diffusion, plaidoyer et exploitation

Dirigé par la Fondation Congolaise pour la Recherche Médicale

WP 6

Coordination et gestion de projets

Dirigé par la Fondation Congolaise pour la Recherche Médicale